まず， Onion 暗号 でググりました．

そうするとTorが出てくるので一瞬「Torに関する問題か?」と思いましたが
暗号文からはどうもそれが思いつかないため，しばらく考えていたら
「エンコードを何重も行う行為として Onion と言っているのでは?」と思いついたので
文字列のそれっぽさからBase64のデコードを何重も行っていました．

そうすると，なんだか begin 666 ... end のような文字列が出てきたので
また暗号かあと思ってググりました．

begin 666 でググると uuencode というもののwikiに当たりました．
beginではじまりendで終わるところもそれっぽいので，ビンゴのようです．
デコードするとフラグが現れます．